Родился в станице Упорной в 1912 году. Проживал в городе Армавире. Мобилизован в Красную Армию Армавирским райвоенкоматом Краснодарского края. Воевал в рядах 2-й мотострелковой бригады на Западном фронте. Убит в бою у села Павловка Ставищанского района Киевской области Украинской ССР 26 января 1944 года. Имя Ивана Сергеевича Матюшенко внесено в 13-й том Книги памяти Краснодарского края.